《经济参考报》记者在调研中发现，经费管理和使用方面存在过细过死、“重物轻人”等问题，制约了科研经费的使用效益。另外，科研体制“九龙治水”导致科技活动“碎片化”、“聚焦难”，科研项目多头申报现象普遍存在，使得国家投入大幅度增加的同时经费使用效率不高。以大气污染科研项目为例，至少有8个部委参与193个立项，其中很多是重复立项。